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Intel tiene nucleos mucho mas rapidos que AMD. Los nucleos virtuales sirven para aprovechar las partes del nucleo que no esten haciendo nada.
Por ejemplo, puedes tener un programa que solo use el ALU y otro que solo use la FPU en un mismo nucleo Intel. Y en programas comunes, si uno de los nucleos virtuales tiene un cache miss, el otro nucleo virtual puede continuar instanteamente lo que hacia, sin que el OS se preocupe de cambier threads.

Y aparte de todo eso, Intel tiene mucho mejor performance por ciclo que AMD. Por eso el Core i3 es casi tan rapido como un phenom x4.