No funciona bajo la lógica de UNIX (no "hace una cosa y la hace bien", se atribuye varias tareas y algunas no las hace bien), tiene demasiadas implementaciones innecesarias (es prácticamente un kernel... dentro del kernel), es altamente vulnerable, su creador es un cocnhadesumadre, etc. Hay demasiadas razones:
http://without-systemd.org/wiki/index.php/Arguments_against_systemd