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Debian tiene sus parches pero no es necesario que los uses. Puedes compilar lo que quieras desde upstream si quieres. Muy probablemente no se le está activando un módulo necesario para bootear al usar localmodconfig. Tampoco me respondió si está recreando su ramdisk. Ni tampoco me explicó por qué está creando un certificado SSL para compilar un kernel el script kiddie lol. El entorno de Debian no tiene nada de "especial" frente a cualquier otra distro.

La última respuesta que te voy a dar es que aprendas de verdad a configurar un kernel. El manual de Gentoo te enseña bien. Lo otro es que uses allmodconfig, no no localmodconfig. Aprende que hacen los módulos en el kernel y qué necesitas para que tu hardware bootee y funcione.